Организация структуры popup окна в OpenCart 3.0 зависит от того, какой функционал вы хотите реализовать. В общем случае, можно рассмотреть следующую структуру:

1. Создайте файл шаблона для popup окна. Обычно это файл с расширением .tpl, который содержит HTML-разметку и JavaScript-код для работы с окном. Этот файл можно разместить в папке catalog/view/theme/default/template/common/ или создать отдельную папку для popup окон.

2. Создайте контроллер для обработки запроса на открытие popup окна. Обычно это файл с расширением .php, который находится в папке catalog/controller/common/. В этом файле вы можете определить необходимые данные для отображения в popup окне и передать их в шаблон.

3. Создайте JavaScript-файл, который будет отвечать за открытие и закрытие popup окна. Обычно этот файл размещается в папке catalog/view/theme/default/js/ и подключается в шаблоне сайта.

4. Добавьте кнопку или ссылку на страницу, которая будет открывать popup окно. Обычно это делается с помощью JavaScript-обработчика события клика на элементе.

5. Подключите контроллер и JavaScript-файл в файле header.tpl, чтобы они были доступны на всех страницах сайта.

Пример кода для открытия popup окна:

$('#popup-link').click(function(e) {
  e.preventDefault();
  $.ajax({
    url: 'index.php?route=common/popup',
    type: 'get',
    dataType: 'html',
    success: function(html) {
      $('#popup-container').html(html);
      $('#popup-container').fadeIn();
    }
  });
});

В данном примере при клике на элемент с id=»popup-link» отправляется AJAX-запрос на контроллер common/popup, который возвращает HTML-код для отображения в popup окне. Этот код добавляется в контейнер с id=»popup-container» и окно отображается с помощью метода fadeIn().